Medi-Helin ensisijaisena tehtävänä on lääkärijohtoisen sairaalatasoisen ensihoidon vieminen mahdollisimman nopeasti hätätilapotilaan luokse. Ensihoidon jälkeen potilas kuljetetaan yleensä Medi-Helin lääkärin valvonnassa ambulanssilla sairaalaan. Kirurgisia toimenpiteitä ja tehohoitoa tarvitsevat potilaat voidaan kuljettaa myös helikopterilla suoraan yliopistosairaalaan. Medi-Helin apu on potilaalle, hälyttäjälle ja potilaan kotikunnalle maksutonta.

Lentäjä, lääkäri ja lentoavustaja päivystävät Medi-Helin tukikohdissa ympäri vuorokauden kolmen minuutin lähtövalmiudessa. Vantaan Medi-Heli 01 saa keskimäärin kuusi hälytystehtävää vuorokaudessa ja Turun Medi-Heli 02 viisi. Medi-Helin hälyttämisestä päätetään hätäkeskuksissa, jonne avuntarvitsijat saavat yhteyden soittamalla yleiseen hätänumeroon 112.